Инспекция создана в 1974 г. с целью обеспечения безопасности плавания маломерных судов и систематического надзора за ними. В том же году введены соответствующие нормы и правила безопасности. Надзору инспекции подлежат все суда длиной менее 12 м, плавающие с удалением до 20 миль от берега.
Управление Государственной инспекции по маломерному флоту находится в Токио, 22 ее отделения расположены по всей Японии. Общее число постоянных работников — 258 чел., временных (сезонных) инспекторов — 96.
За три года проверено 224137 судов (из них — 205538 проходят периодический осмотр). На судостроительных и моторостроительных предприятиях проведено 93173 проверки (проверены 38 295 корпусов судов, 41674 стационарных двигателя). Проведены испытания 1 798 639 различных изделий для малых судов, в том числе 1281830 спасательных средств и приборов, 103330 противопожарных устройств.